На суперкомпьютере «Ломоносов» запущены расчеты для поиска лекарств от COVID-19

Сотрудники лаборатории вычислительных систем и прикладных технологий программирования НИВЦ МГУ запустили масштабные расчеты на суперкомпьютере «Ломоносов», которые помогут найти лекарство прямого действия от коронавируса.

Именно использование сверхмощных вычислительных систем помогает значительно ускорить подбор молекул для будущих лекарств благодаря технологиям молекулярного моделирования и докинга (особый вид молекулярного моделирования). Для успеха такой разработки необходима непрерывная работа целого конвейера – поиск нужных молекул, дизайн новых молекул и их суперкомпьютерный докинг, экспериментальное тестирование активности найденных молекул, синтез новых молекул и экспериментальная проверка их активности. «Для многих болезней определены белки, которые отвечают за развитие патологий. Это могут быть вирусные белки, отвечающие за размножение вируса в организме или собственные белки человека, которые работают неправильно. И если мы заблокируем работу такого белка-мишени с помощью молекулы, которая избирательно свяжется с ним в его активном центре, то развитие болезни приостановится», – комментирует заведующий лабораторией вычислительных систем и прикладных технологий программирования НИВЦ МГУ Владимир Сулимов. Запущенные масштабные расчеты будут длиться несколько дней. На основе анализа структуры вируса и определения его белков-мишеней учеными был выбран один из таких белков, проанализирована пространственная структура этого белка и его комплексов. На основе таких структур сделаны модели для докинга. Сейчас среди этих соединений необходимо найти молекулы, наиболее сильно связывающиеся с белком-мишенью. Результаты работы проверят экспериментально в лаборатории противовирусных и дезинфекционных средств Института вирусологии им. Д. И. Ивановского. Суперкомпьютерный комплекс Московского университета является самым мощным в России.

Источник: https://gmpnews.ru/2020/04/na-superkompyutere-lomonosov-zapushheny-raschety-dlya-poiska-lekarstv-ot-covid-19/

8.04.2020

Ajax Call Form
Loading...
Translate »