Нейросеть ищет самые опасные мутации COVID-19

Исследователи из Пенсильванского университета создали новую структуру, предсказывающую аминокислотные изменения в спайковом белке вируса, которые могут сделать SARS-CoV-2 еще заразнее.

Новый инструмент может предупредить потенциально опасные варианты развития вируса, которые будут связываться с клетками человека еще активнее. Если биологи будут заранее знать о возможных мутациях, это поможет легче бороться с ними.  Важно иметь возможность заранее оценить, как изменения аминокислот могут повысить инфекционность вируса. Наша структура — это мощный инструмент для того, чтобы понять, как аминокислоты влияют на изменений в спайковом белке SARS-CoV-2. Авторы новой работы использовали двухэтапную вычислительную процедуру, чтобы создать модель для прогнозирования изменений в аминокислотах — это строительный материал для всех белков в организме. Изменения могут произойти в процессе связывания рецепторов (RBD) спайкового белка SARS-CoV-2. Это повлияет на способность вируса связываться с рецепторами ACE2 клеток человека и других животных. Во время работы исследователи обучили нейросеть на экспериментальных данных об активности нового типа коронавируса в зависимости от изменений в одной аминокислоте. Они обнаружили, что могут с точностью около 80% предсказать, улучшат или ухудшат определенные изменения аминокислот способность SARS-CoV-2 заражать людей и животных.  Модель также предсказала, как изменения в аминокислотах SARS-CoV-2 отразились на активности альфа, бета, гамма и дельта вариантов.

Источник: https://hightech.fm/2021/09/30/more-infectiou

4.10.2021