Последовательность РНК в вакцине Moderna восстановили по остаткам из ампул и выложили на GitHub

Группа медиков из Стэнфордского университета восстановила последовательность РНК, которая входит в состав коронавирусной вакцины Moderna и до сих пор не была нигде опубликована.

Для этого исследователи собрали и отсеквенировали остатки вакцины со стенок ампулы после использования. Результаты работы они выложили на GitHub. Этот едва ли позволит кому-то сделать вакцину своими руками, зато поможет точнее отличать РНК самого коронавируса от РНК вакцины в биологических образцах. Главное действующее вещество мРНК-вакцин — вирусный ген, который «заражает» человеческие клетки и заставляет их производить вирусные белки. Но напрямую вставить вирусную РНК в вакцину получается не всегда. Наоборот, чтобы заставить клетку работать с этой мРНК как с собственной, разработчикам вакцин приходится тщательно редактировать исходную вирусную последовательность. Например, они могут заменить в ней некоторые нуклеотиды на искусственные — чтобы иммунные клетки человека не признали в ней чужеродную РНК. Кроме того, по краям вирусного гена приходится добавлять регуляторные участки, которые послужат сигналами о том, что именно эту информацию клетка срочно должна реализовать. Таким образом, итоговая вирусная РНК в вакцине может оказаться совсем не похожа на оригинал. А несколько разных мРНК-вакцин могут быть непохожи друг на друга — в зависимости от решений, которые принимает каждый конкретный разработчик. Первой мРНК-вакциной от коронавируса, которую одобрили для применения, стала разработка компаний Pfizer и BioNTech. Последовательность РНК, которая входит в ее состав, ВОЗ опубликовала еще осенью 2020 года. Но широко обсуждаться она стала только в декабре — после того, как американский разработчик Берт Хуберт подробно ее проанализировал. Последовательность второй мРНК-вакцины — компании Moderna — до сих пор не была опубликована в открытом доступе. Поэтому группа исследователей из Стэнфордской медицинской школы решила восстановить ее своими руками. Для этого они использовали пустые ампулы, которые остались в стэнфордском пункте вакцинации. А поскольку вакцины обычно разливают по ампулам с небольшим запасом, то исследователям удалось собрать со стенок остатки жидкости, выделить и отсеквенировать РНК. Чтобы проверить действенность своего метода, авторы работы проделали то же самое с пустой ампулой из-под вакцины Pfizer. Они обнаружили, что собранная ими последовательность РНК из вакцины Pfizer совпадает с той, которую обсуждали в конце декабря 2020-го года.  Теперь в открытом доступе есть уже две последовательности мРНК-вакцин. Это, впрочем, вовсе не означает, что любой энтузиаст может по этим «схемам» собрать себе вакцину самостоятельно. Тем не менее стэнфордские исследователи считают, что их результат можно будет потом использовать и в других исследованиях. По мере того как вакцинация набирает обороты, в окружающей среде и человеческих биоматериалах появляется все больше вакцинной мРНК — и хорошо бы уметь отличить ее от исходной вирусной РНК, например, чтобы более точно отслеживать распространение вируса.

Источник: https://nplus1.ru/news/2021/03/30/moderna-sequenced?utm_source=Telegram&utm_medium=Social

5.04.2021