Recursion и Genentech валидировали первую нейромишень, открытую с помощью ИИ

Сотрудничество Recursion, Roche и её дочерней компании Genentech в области разработки лекарств на основе искусственного интеллекта (ИИ) объёмом до $12 млрд достигло важной вехи. Компании объявили о планах совместно разрабатывать программу раннего поиска малых молекул для нейронауки на основе первой валидированной мишени, обнаруженной с помощью созданной ими AI-карты.

Genentech воспользовалась опционом на первую валидированную мишень после того, как приняла от Recursion пакет валидационных данных по этой мишени. Это решение запускает выплату Recursion в размере $3 млн. Общая сумма денежных выплат, полученных Recursion от биофармацевтических гигантов с момента запуска партнёрства в 2021 году, достигла $216 млн.

По каждой разрабатываемой программе Recursion может получить до $300 млн в виде платежей, привязанных к достижению этапов разработки, коммерциализации и чистых продаж, а также роялти за каждую программу с малыми молекулами. Roche и Genentech обязались использовать платформу Recursion для продвижения терапий по 40 программам, охватывающим «ключевые области» нейронауки и нераскрытое показание в гастроинтестинальной онкологии.

Компании не разглашают, что это за мишень и какие неврологические расстройства она потенциально может лечить. Однако Recursion сообщает, что переход от начала валидации мишени до пакета валидационных данных занял 15 месяцев.

Значимость этой мишени, по мнению Recursion и её партнёров, заключается в её потенциале расширить вселенную методов лечения неврологических заболеваний за пределы нескольких известных мишеней в этой области.

Хотя более трёх миллиардов человек в мире страдают от неврологических заболеваний, только один из 40 нейронаучных препаратов, когда-либо дошедших до клиники, получил одобрение. Лишь 8,4% кандидатов в неврологические препараты, вступающих в I фазу исследований, доходят до регистрации, согласно исследованию Clinical Development Success Rates 2006-2015, опубликованному Biotechnology Innovation Organization (BIO), BioMedTracker и Amplion (приобретена в 2022 году Science and Medicine Group, или SMG).

«Поиск новых мишеней в нейронауке всегда был сложной задачей, и эта веха демонстрирует нашу способность раскрывать новую биологию в областях, где традиционные подходы испытывали трудности», — заявила генеральный директор Recursion Наджат Хан.

Новые инструменты — новая надежда

Новую надежду на открытие и разработку новых нейронаучных препаратов дают новые инструменты для изучения в основном неизведанного генома в живых нейронах.

Эти новые инструменты начинаются с Data Factory Recursion — сквозной платформы, разрабатываемой и совершенствуемой более десяти лет для создания повторяемой и масштабируемой системы генерации биологических данных, предназначенной для ИИ-моделей.

В партнёрстве с Roche и Genentech Recursion создала первую полногеномную CRISPR-нокаутную карту, полученную из субпопуляции более одного триллиона собственных нейрональных клеток, произведённых из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (iPSC), — что соответствует примерно 12 человеческим мозгам. Внешние производители клеток заявили партнёрам, что запрашиваемый масштаб производства слишком сложен и дорог для реализации.

«Клеточный контекст важен. Мы начинаем с человеческих iPSC и направляем их в очень чёткую гомогенную популяцию нейронов, которую мы можем тестировать — и мы делаем это в масштабе», — сказал Уинроу. «Нужен определённый период дифференцировки, чтобы iPSC превратились в нужные для изучения нейроны. Также необходим контроль качества, чтобы убедиться, что эти нейроны соответствуют ожиданиям и что это надёжно и воспроизводимо».

Recursion подвергла потенциальные мишени, которые они идентифицировали, тщательному процессу валидации, разработанному совместно с Genentech. Кандидатные мишени проходили последовательные этапы валидации путей, функциональной валидации и валидации заболевания, чтобы определить, изменяет ли модуляция мишени фенотип неврологического заболевания. Только мишени, последовательно демонстрировавшие убедительные доказательства на каждом этапе, попадали в валидационный пакет.

Исследователи из Recursion и Genentech применили набор крупномасштабных модификаций, используя полногеномные CRISPR-Cas9-нокауты, охватывающие более 17 000 генов и тысячи малых молекул.

Более 46 миллионов изображений

После производства клеток и внесения модификаций следующий этап включает визуализацию, предназначенную для захвата более 46 миллионов клеточных изображений. Каждое изображение анализируется по сотням признаков, таких как форма митохондрий, морфология ядра, с использованием фундаментальных ИИ-моделей.

Полученные данные анализируются для выявления закономерностей, напоминающих биологию заболеваний, с использованием суперкомпьютера Recursion BioHive-2, завершённого в 2024 году на основе технологий Nvidia и собственных ИИ-моделей. Эти идеи затем превращаются в гипотезы, направляющие дальнейшие исследования и, в конечном итоге, валидированные мишени.

Следующие шаги

В дальнейшем партнёры планируют продвигать программы поиска от мишени к лекарству с использованием химической платформы Recursion для разработки потенциального первого в своём классе препарата, а также идентификацию и валидацию дополнительных мишеней для потенциальных новых программ.

Recursion заявила, что продолжит объединять свой феномиксный набор данных с собственными транскриптомными данными Genentech для создания дополнительных мультимодальных карт, предназначенных для изучения потенциальных новых мишеней и путей путём систематической связи генных модификаций с клеточными фенотипами.

Нейрональная карта — одна из двух полногеномных нейронаучных фенокарт, созданных в рамках партнёрства Recursion-Roche-Genentech. Другая — карта специализированных иммунных клеток микроглии, представленная в прошлом году, которую компании также планируют использовать для выявления значимых новых мишеней при нейродегенеративных заболеваниях.

«Это даёт нам две различные, но ориентированные на ЦНС карты, уходящие корнями в человеческую биологию. Возможности действительно есть для глубокого изучения обеих. Нейрокарта немного впереди, и мы смогли применить некоторые уроки, извлечённые там, к нашей работе со стороны микроглии», — отметили ученые.

Две нейронаправленные карты, в свою очередь, являются частью шести полногеномных фенокарт, созданных компаниями; остальные четыре предназначены для поиска мишеней по одному нераскрытому показанию в гастроинтестинальной онкологии. Карты позволяют Recursion, Roche и Genentech исследовать потенциально неоткрытые мишени и пути, систематически связывая генные модификации с клеточными фенотипами.

Источник: https://www.genengnews.com/

10.08.2026