Составлен полный атлас взаимодействий SARS-CoV-2 с клетками человека
Ученые из Германии и США составили первый глобальный атлас прямых взаимодействий между РНК коронавируса SARS-CoV-2 и людскими клетками-хозяевами.
Это может явиться отправной точкой для создания современных методов лечения COVID-19 и других инфекций, вызванных РНК-вирусами. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature Microbiology. Для проникновения и роения SARS-CoV-2 использует белки клеток-хозяев. Однако до сих пор не существовало подробной информации о протеоме человека, то есть о совокупности всех белков, встречающихся в клетках человека, какие находятся в прямом контакте с вирусной РНК. Немецкие исследователи из Института Гельмгольца по исследованию инфекций на основе РНК в Вюрцбурге, Университета Юлиуса-Максимилиана в Вюрцбурге вместе с американскими коллегами из Института Броуда в Кембридже создали первый глобальный атлас прямых взаимодействий между РНК SARS-CoV-2 и протеомом потребителя. Сначала ученые заразили человеческие клетки современным коронавирусом, а потом «обворовали» вирусную РНК и идентифицировали сопряжённые с ней белки методом масс-спектроскопии. Масс-спектрометрия позволяет точно определить белки-хозяева, которые напрямую связаны с вирусным геномом. Авторы выяснили, что ключевую роль в заражении коронавирусом играют 18 белков-хозяев. Два из них — CNBP и LARP1 — особенно важны. Используя генетические инструменты, ученые определили точные сайты связывания этих двух белков-хозяев в вирусном геноме и показали, что они могут специфически ингибировать репликацию микроба. Определение LARP1 как противовирусного эффекта — важное открытие. Способ связывания LARP1 с вирусной РНК очень интересен, потому, что он похож на способ, которым LARP1 регулирует определенные клеточные РНК-мессенджеры, которые ученые уже знают. «Атлас взаимодействий между вирусной РНК и белками предлагает уникальное понимание механизма инфекции SARS-CoV-2 и позволяет системно разрушать центральные факторы и стратегии защиты, что организует важнейшую предпосылку для разработки современных терапевтических стратегий», — говорит один из авторов исследования Йохен Бодем (Jochen Bodem) из Института вирусологии и иммунологии Университета Юлиуса-Максимилиана. Кроме того, определили еще 20 регуляторов вирусной репликации —низкомолекулярных ингибиторов белков-хозяев, которые связывают РНК SARS-CoV-2. Три или четыре из них фактически полностью подавляют репликацию микроба в различных типах клеток потребителя. Этот результат может зарегистрировать новые способы лечения инфекций, вызванных SARS-CoV-2 и другими РНК-вирусами, считают исследователи.
28.12.2020