Ученые сделали модель S-белка: он помогает COVID-19 проникать в организм

Группа исследователей из Сеульского национального университета в Южной Корее совместно с коллегами из Кембриджского университета в Великобритании и Университета Лихай в США создали модель S-белка.

Он играет центральную роль в проникновении вируса SARS-CoV-2 в клетки хозяева. Изучение поможет подробнее понять этот процесс, а позже и предотвратить. Информация об исследовании опубликована в статье The Journal of Physical Chemistry B. Ученые разработали программу, которая быстро моделирует сложные биомолекулярные системы. Это что-то вроде «вычислительного микроскопа», который позволяет ученым понять взаимодействие в структуре белка на молекулярном уровне. Это нужно для того, чтобы понять как COVID-19 проникает в организм человека.  Вонпилоу Им, профессор факультета биологических наук и биоинженерии Университета Лихай: «Наши модели — это первые полностью гликозилированные полноразмерные модели белка SARS-CoV-2 шипа (S), доступные другим ученым. Наша команда потратила дни и ночи, чтобы построить модели на уровне криоэлектронной микроскопической (крио-ЭМ) структуры». Структуру белка S определяют с помощью крио-ЭМ структуры, но эта модель имеет много «слепых пятен». Поэтому ученые сначала смоделировали недостающие аминокислотные остатки, а затем и другие области. Кроме того, группа ученых смоделировала все потенциальные гликаны (или углеводы), связанные с S-белком. Эти гликаны предотвращают распознавание антител, что затрудняет разработку вакцины. Они также создали вирусную мембранную систему белка S для моделирования молекулярной динамики. Ученые планируют использовать эти модели для проведения новых исследований по профилактике и лечению COVID-19.

Источник: https://hightech.fm/2020/06/22/covid-19-protein

24.06.2020