Вакцине предрекли одинаковую эффективность против всех текущих вариантов SARS-CoV-2

Сравнение 18514 геномов SARS-CoV-2 показало что — вопреки опасениям — этот вирус достаточно консервативен и его варианты должны одинаково узнаваться разрабатываемыми вакцинами.

Большая часть найденных исследователями мутаций носят нейтральный или негативный характер для вируса, а популярность нескольких мутаций вроде D614G может быть объяснена эффектом основателя. Работа опубликована в журнале PNAS. В основе коронавируса лежит молекула РНК, которая сильнее склонна к мутациям, если сравнивать с ДНК. Именно это свойство РНК-вирусов не позволяет пока создать универсальную вакцину от гриппа, у которого много разных изменчивых штаммов, сменяющих друг друга. Ученым приходится каждый год предсказывать какой именно вирус окажется популярным в этом сезоне, и на основе этих предсказаний адаптировать вакцину. Нечто подобное ожидалось и от нового коронавируса, но он оказался не таким изменчивым, а новая работа и вовсе утверждает, что менять вакцину от коронавируса каждый год не придется. Бетани Дирлав (Bethany Dearlove) и ее коллеги из Армейского научно-исследовательского института имени Уолтера Рида сделали этот вывод, проанализировав 18514 геномов SARS-CoV-2, собранных зимой и весной 2020 года в 84 странах мира. Чтобы оценить изменчивость вируса, исследователи сравнили последовательности и выяснили, что из 29409 букв генома SARS-CoV-2 7559 оказались полиморфными, то есть смутировали хотя бы в каком-то из исследованных геномов. На первый взгляд кажется, что это много, но большая часть этих мутаций встречается всего по одному разу (5085), а отличие между двумя случайно выбранными геномами невелико. В базе GISAID встречаются геномы, накопившие, на первый взгляд, много мутаций, но обычно они оказываются на поверку техническими артефактами. Всего семь мутаций встречаются чаще чем в 10 процентах исследованных случаев, причем три из них связаны друг с другом. Сравнив количество синонимичных и несинонимичных замен, авторы статьи пришли к выводу, что большая часть позиций в геноме SARS-CoV-2 находится под очищающим отбором и мутации там скорее нежелательны для вируса, особенно на белок-кодирующих участках. Особенно тщательно они проинспектировали RBD домен S-белка, играющий ключевую роль в заражении и известный своей варибельностью среди коронавирусов. Тем не менее они не обнаружили там ни одной мутации, встречающейся больше чем в 0,2 процента случаев. Основываясь на этом анализе не стоит ожидать того, что отдельные штаммы вируса быстро мутируют и станут сильно друг от друга отличаться.

Источник: https://nplus1.ru/news/2020/09/01/one-ring-to-rule-them-all?utm_source=Telegram&utm_medium=Social

7.09.2020