Вычислительный метод на основе физики помог отследить передачи мутаций SARS-CoV-2

Ученые Калифорнийского университета разработали новый вычислительный метод, позволяющий отслеживать, как конкретные мутации влияют на передачу SARS-CoV-2.

Это поможет лучше понять биологию вируса и контролировать вспышки. Для создания нового метода такого наблюдения и анализа, ученые использовали математические модели статистической физики в эпидемиологии. Разработанный ими метод позволяет просматривать данные геномного наблюдения с течением времени и во многих регионах мира, а также находить влияние различных мутаций на передачу SARS-CoV-2. Исследование показало, что данный метод лучше всего объясняет эволюцию вируса на протяжении всей пандемии COVID-19. «Несколько новых особенностей нашего метода заключаются в том, что он может учитывать перемещение инфицированных людей между регионами. Другие модели на это неспособны. Наш метод основан на физике и позволяет записать точное математическое выражение для эффектов передачи различных мутаций, а не полагаться на численное моделирование для оценки этих параметров», — объясняет Джон Бартон, профессор кафедры физики и астрономии Калифорнийского университета в Риверсайде. Метод также достаточно чувствителен, чтобы выявить механизмы передачи SARS-CoV-2, которые ранее считались нейтральными. После проверки метода ученые применили его к более чем 1,6 млн последовательностей SARS-CoV-2 из базы данных GISAID, собранных в 87 географических регионах. Результаты исследования разработчики представят на мартовском собрании Американского физического общества.

Источник: https://hightech.fm/2022/02/07/physics-mutations

14.02.2022